L’EPER compte quinze départements et bureaux régionaux, subordonnés aux cinq divisions suivantes : internationale, Suisse, communication, services et Siège romand. Les cinq responsables de département de la division Suisse dirigent les bureaux régionaux d’Argovie / Soleure, du Grand Bâle, de Berne, de Suisse orientale et de Zurich / Schaffhouse.
